Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcf4Q60722 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms