Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms