Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim58Q5NCC9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim58Q5NCC9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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