Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Fam220aQ3ZN08 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam220aQ3ZN08 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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