Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC051142Q3V0M8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC051142Q3V0M8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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BC051142Q3V0M8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC051142Q3V0M8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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