Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp48Q3V0C5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp48Q3V0C5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp48Q3V0C5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp48Q3V0C5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp48Q3V0C5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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