Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms