Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capn13Q3UW68 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Capn13Q3UW68 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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