Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D130052B06RikQ3UW13 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms