Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms