Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec31aQ3UPL0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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