Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Parp3Q3ULW8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Parp3Q3ULW8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms