Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf224Q3UIW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms