Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trafd1Q3UDK1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms