Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rnf149Q3U2C5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf149Q3U2C5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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