Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
InipQ3TXT3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms