Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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