Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc13Q3TIR1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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