Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2afvQ3THW5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms