Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms