Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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KncnQ307W7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KncnQ307W7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 448.8 ms