Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam178bQ24JP3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam178bQ24JP3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms