Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Traf3ip1Q149C2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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