Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrriq1Q0P5X1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrriq1Q0P5X1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms