Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Calb2Q08331 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Calb2Q08331 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms