Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Gdf3Q07104 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gdf3Q07104 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms