Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms