Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1sQ02789 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1sQ02789 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms