Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms