Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou1f1Q00286 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms