Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mesp1P97309 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms