Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl21cP86793 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccl21cP86793 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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