Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Arf1P84078 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Arf1P84078 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms