Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx2P80206 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms