Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtnP63089 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtnP63089 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms