Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms