Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lmo4P61969 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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