Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
PlnP61014 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms