Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Polr2iP60898 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Polr2iP60898 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms