Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pcmtd1P59913 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pcmtd1P59913 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcmtd1P59913 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pcmtd1P59913 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pcmtd1P59913 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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