Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CgnP59242 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CgnP59242 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CgnP59242 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms