Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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