Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn18P56857 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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