Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
XpcP51612 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
XpcP51612 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XpcP51612 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
XpcP51612 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XpcP51612 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XpcP51612 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms