Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TspoP50637 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TspoP50637 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms