Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SftpdP50404 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms