Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TgfaP48030 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TgfaP48030 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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