Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
LtbP41155 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
LtbP41155 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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