Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VhlP40338 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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VhlP40338 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
VhlP40338 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
VhlP40338 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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