Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Chd1P40201 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chd1P40201 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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